Výskum v spôsobe pôsobenia kvapaliny-19 bioinformatickou analýzou a simuláciou molekulárnej dynamiky

Výskum v spôsobe pôsobenia kvapaliny-19 bioinformatickou analýzou a simuláciou molekulárnej dynamiky

Nová štúdia skúma účinnosť sladkého drievka pri liečbe Covid-19

Nedávno publikovaná štúdia v časopise Frontiers vo farmakológii skúma účinnosť alkoholu pri liečbe koronavírusovej choroby 2019 (Covid-19). Vedci identifikovali rôzne mechanizmy, prostredníctvom ktorých alkoholu znižuje zápalovú reakciu, inhibuje poškodenie tkaniva a bunkovú smrť, reguluje prežitie buniek a podporuje rast tkaniva po infekcii závažným akútnym koronavírusom 2 (SARS-2).

Pozadie

Vzhľadom na nedostatok účinných terapeutických látok Covid-19 s niekoľkými vedľajšími účinkami sa mnohé rastlinné lieky ukázalo ako účinné pri obmedzovaní penetrácie a zvýšenia SARS-COV v hostiteľských bunkách. Rôzne štúdie ukázali, že mnoho aktívnych spojení v Licorice môžu napríklad účinne neutralizovať SARS-COV-2 a minimalizovať príznaky Covid-19. Tieto účinky budú pravdepodobne založené na schopnosti týchto zložiek interagovať interakciu medzi receptorovou časťou domény (RBD) SARS-COV-2 a receptorom hostiteľskej bunky konvertujúcej angiotenzín-Ezym 2 (ACE2). Okrem toho quercetín, aktívne spojenie v sladkej drobnosti, zjavne zrkadlo cytokínového interleukínu-6 (IL-6), zatiaľ čo Triteroid Lacritz-saponín A3 (A3) a kyselina glycyrhicová (GA) inhibuje RBD SARS-Cov-2 a nepredstaviteľného proteínu 7 (NSP7).

Štúdia

Vedci používali bioinformatické analýzy, metódy molekulárneho hojdačky a simulácie molekulárnej dynamiky na stanovenie afektívnej účinnosti rôznych zložiek s alkoholom a aktívne v porovnaní s rôznymi vírusovými cieľovými štruktúrami. Simulácia molekulárnej dynamiky navyše umožnila vyhodnotenie stability týchto viazaných komplexov pre ďalšie analýzy. Vedci tiež použili rôzne bioinformatické platformy na preskúmanie potenciálnych mechanizmov aktivity alkoholu proti SARS-COV-2.

Výsledky štúdie

Z databázy tradičnej farmakológie čínskej medicíny (TCMSP) sa zvolalo 200 pripojení z alkoholu, z ktorých 11 bolo vybratých. Z celkového počtu 255 a 4 628 génov alkoholu alebo Covid-19 bolo identifikovaných 101 spoločných cieľov. Týchto 101 génov sa označuje ako „základné prierezové génové ciele“. Následná analýza týchto génov ukázala, že súvisia s prenosom cytokínu a zápalovými reakciami. Ďalším výsledkom bolo, že sladké drievko reguluje génovú expresiu, zápalovú reakciu cytokínov a rôzne signálne dráhy.

Na základe analýzy molekulárnej dokovania boli identifikované početné interakcie medzi zložkami aktívnymi alkoholom a vírusovými cieľovými štruktúrami. Niektoré z nich sú CXCL8/Phasel, IL2RA/Glycyrol, STAT3/Glycyrol a MMP1/Glyaspern F. Tieto interakcie môžu inhibovať zápalové procesy, aktivovať imunitný systém a podporovať rast tkaniva.

Závery

Táto štúdia poskytuje v Silico predpovede, ako môžu rôzne aktívne zložky interagovať v sladkej drobnosti s rôznymi destináciami SARS-COV-2. Tieto zistenia ponúkajú nové pohľady na mechanizmy, prostredníctvom ktorých môžu určité aktívne zložky alkoholu vyvinúť svoj antivírusový účinok. Malo by sa však poznamenať, že na potvrdenie skutočnej účinnosti tekutiny na 19 kvapalín-19 sú potrebné ďalšie vyšetrenia a klinické štúdie.

Referencia:
Cao, J., Gong, Y., Wu, M., a kol. (2022). Preskúmanie mechanizmu pôsobenia sladkého drievka pri liečbe Covid-13 pomocou bioinformatickej analýzy a simulácie molekulárnej dynamiky. Hranice vo farmakológii. Doi: 10,3389/fphar.2022.1003310