Pētījumi šķidruma-19 darbības režīmā ar bioinformātisko analīzi un molekulārās dinamikas simulāciju

Pētījumi šķidruma-19 darbības režīmā ar bioinformātisko analīzi un molekulārās dinamikas simulāciju

Jauns pētījums pārbauda lakricas efektivitāti CoVID-19

Nesen publicēts pētījums žurnālā Frontiers in farmakoloģijā apskata lakricas efektivitāti koronavīrusu slimības 2019. gada ārstēšanā (COVID-19). Pētnieki ir identificējuši dažādus mehānismus, ar kuru palīdzību lakrica samazina iekaisuma reakciju, kavē audu bojājumus un šūnu nāvi, regulē šūnu izdzīvošanu un veicina audu augšanu pēc inficēšanās ar smagu akūtu elpošanas sindromu koronavīrusu 2 (SARS-COV-2).

fons

Ņemot vērā efektīvu COVID-19 terapeitisko līdzekļu trūkumu ar dažām blakusparādībām, daudzas dārzeņu zāles ir izrādījušās efektīvas, ierobežojot iespiešanās un SARS-COV palielināšanos saimnieka šūnās. Dažādi pētījumi parādīja, ka, piemēram, daudzi aktīvi savienojumi lakricā var efektīvi neitralizēt SARS-COV-2 un samazināt CoVID-19 simptomus. Šie efekti, visticamāk, ir balstīti uz šo komponentu spēju mijiedarboties ar SARS-COV-2 receptoru daļas domēna (RBD) mijiedarbību un angiotenzīna konvertējošo-EZYM 2 (ACE2) resursdatora receptoru receptoru. Turklāt kvercetīns, aktīvs savienojums lakricā, acīmredzot citokīnu interleikīna-6 (IL-6) spogulis, savukārt triteroīda lakrica-Saponīna A3 (A3) un glicirikskābe (GA) inhibē SARS-COV-2 un nestrukturālo proteīnu 7 (NSP7).

Pētījums

Pētnieki izmantoja bioinformātiskas analīzes, molekulāro šūpošanas metodes un molekulārās dinamikas simulācijas, lai noteiktu dažādu šķidrumu faktiski komponentu afektīvo efektivitāti salīdzinājumā ar dažādām vīrusu mērķa struktūrām. Turklāt molekulārās dinamikas simulācija ļāva novērtēt šo saistīto kompleksu stabilitāti turpmākai analīzei. Zinātnieki arī izmantoja dažādas bioinformātiskas platformas, lai pārbaudītu lakricas pret SARS-COV-2 iespējamos darbības mehānismus.

Pētījuma rezultāti

No tradicionālās ķīniešu medicīnas sistēmas farmakoloģijas datu bāzes (TCMSP) datu bāzes tika izsaukti 200 savienojumi no lakricas, no kuriem 11 tika izvēlēti. No kopumā 255 un 4628 lakricas vai COVID-19 gēniem tika identificēti 101 kopīgs mērķis. Šie 101 gēni tiek saukti par "galveno starpnozaru gēnu mērķiem". Turpmākā šo gēnu analīze parādīja, ka tie ir saistīti ar citokīnu pārnešanu un iekaisuma reakcijām. Vēl viens rezultāts bija tas, ka lakrica regulē gēnu ekspresiju, citokīnu un dažādu signālu ceļu iekaisuma reakciju.

Balstoties uz molekulāro dokstacijas analīzi, tika identificēta daudzas mijiedarbības starp šķidrumu aktīvajām sastāvdaļām un vīrusu mērķa struktūrām. Daži no tiem ir CXCL8/Phasel, IL2RA/glicyrol, STAT3/Glicyrol un MMP1/Glyaspern F. Šīs mijiedarbības var kavēt iekaisuma procesus, aktivizēt imūnsistēmu un veicināt audu augšanu.

Secinājumi

Šajā pētījumā silico prognozes sniedz prognozes, kā dažādas aktīvās sastāvdaļas var mijiedarboties lakricā ar dažādiem SARS-COV-2 galamērķiem. Šie atklājumi piedāvā jaunu ieskatu mehānismos, caur kuriem noteiktas aktīvās lakricas sastāvdaļas var attīstīt pretvīrusu efektu. Tomēr jāatzīmē, ka ir nepieciešami turpmāki izmeklējumi un klīniskie pētījumi, lai apstiprinātu šķidruma-19-19 faktisko efektivitāti.

Atsauce:
Cao, J., Gong, Y., Wu, M., et al. (2022). Izpētīt lakricas darbības mehānismu COVID-13 ārstēšanā, izmantojot bioinformātikas analīzi un molekulārās dinamikas simulāciju. Robežas farmakoloģijā. Doi: 10.3389/fphar.2022.1003310