Tiriant saldymedžio efektyvumą gydant Covidid-19 per bioinformatikos analizę ir molekulinės dinamikos modeliavimą

Tiriant saldymedžio efektyvumą gydant Covidid-19 per bioinformatikos analizę ir molekulinės dinamikos modeliavimą

Naujame tyrime nagrinėjamas saldymedžio efektyvumas gydant Covidid-19

Neseniai paskelbtame tyrime „Žurnalo Frontiers“ farmakologijoje tiriamas saldymedžio veiksmingumas gydant koronavirusą ligą 2019 (Covid-19). Tyrėjai nustatė įvairius mechanizmus, kuriais saldymedis sumažina uždegiminį atsaką, slopina audinių pažeidimus ir ląstelių mirtį, reguliuoja ląstelių išgyvenimą ir skatina audinių augimą po užsikrėtimo sunkaus ūminio kvėpavimo sindromo koronaviruso 2 (SARS-COV-2).

fonas

Atsižvelgiant į tai, kad nėra veiksmingų Covidid-19 terapijos, turinčios nedaug šalutinių poveikių, daugelis vaistažolių vaistų įrodė, kad yra veiksmingi ribojant SARS-COV-2 patekimą ir replikaciją šeimininko ląstelėse. Įvairūs tyrimai parodė, kad, pavyzdžiui, daugelis aktyvių saldymedžių junginių gali efektyviai neutralizuoti SARS-COV-2 ir sumažinti Covidid-19 simptomus. Šis poveikis greičiausiai atsiranda dėl šių komponentų sugebėjimo sutrikdyti SARS-COV-2 receptorių surišimo domeno (RBD) ir šeimininko ląstelės angiotenzino konvertuojančio fermento (ACE2) receptoriaus sąveiką. Be to, atrodo, kad kvercetinas, aktyvus saldymedžio junginys, sumažina citokinų interleukino-6 (IL-6) lygį, o triterpenoidinis saldymedis saponinas A3 (A3) ir glicirrhizo rūgštis (GA) slopina SARS-COV-2 ir nestruktūrinio baltymo 7 (NSP7) RBD.

Tyrimas

Tyrėjai naudojo bioinformatikos analizę, molekulinių dokų metodus ir molekulinės dinamikos modeliavimą, kad nustatytų skirtingų aktyvių saldymedžių komponentų afektinį efektyvumą prieš skirtingus viruso taikinius. Be to, molekulinės dinamikos modeliavimas leido įvertinti šių surištų kompleksų stabilumą tolesnei analizei. Mokslininkai taip pat naudojo įvairias bioinformatikos platformas, norėdami ištirti „Screstrations“ potencialius veikimo mechanizmus prieš SARS-COV-2.

Tyrimo rezultatai

Iš tradicinės Kinijos medicinos sistemos farmakologijos duomenų bazės (TCMSP) buvo paimti 200 saldymedžių junginių, iš kurių buvo pasirinkta 11. Iš visų 255 ir 4628 genų taikinių atitinkamai buvo nustatyta, kad buvo nustatyta atitinkamai saldymedis ir Covidid-19, buvo nustatyti 101 bendrieji taikiniai. Šie 101 genai yra vadinami „pagrindinių susikirtimo genų taikiniais“. Vėlesnė šių genų analizė parodė, kad jie buvo susiję su citokinų perdavimu ir uždegiminėmis reakcijomis. Kita išvada buvo ta, kad saldymedis reguliuoja genų ekspresiją, citokinų uždegiminį atsaką ir įvairius signalizacijos kelius.

Naudojant molekulinės doko analizę, buvo nustatyta daugybė sąveikų tarp saldymedžio aktyvių ingredientų ir viruso tikslinių struktūrų. Kai kurie iš jų yra CXCL8/PHASEOL, IL2RA/GLYCYROL, STAT3/GLYCYROL ir MMP1/GLYASPERN F. Šios sąveikos gali slopinti uždegiminius procesus, suaktyvinti imuninę sistemą ir skatinti audinių augimą.

Išvados

Šiame tyrime numatytos silico prognozės apie tai, kaip skirtingi aktyviosios medžiagos saldymedis gali sąveikauti su skirtingais SARS-COV-2 taikiniais. Šios išvados suteikia naujų įžvalgų apie mechanizmus, per kuriuos tam tikros aktyvios saldymedžio ingredientai gali sukelti antivirusinį poveikį. Tačiau reikia pažymėti, kad norint patvirtinti tikrąjį saldymedžio veiksmingumą gydant Covid-19, reikia atlikti tolesnius tyrimus ir klinikinius tyrimus.

Nuoroda:
Cao, J., Gong, Y., Wu, M. ir kt. (2022). Tiriant saldymedžio veikimo mechanizmą gydant Covidid-19 per bioinformatikos analizę ir molekulinės dinamikos modeliavimą. Farmakologijos sienos. doi: 10.3389/fphar.2022.1003310