Έρευνα στον τρόπο δράσης του υγρού-19 με βιοπληροφορική ανάλυση και προσομοίωση μοριακής δυναμικής

Έρευνα στον τρόπο δράσης του υγρού-19 με βιοπληροφορική ανάλυση και προσομοίωση μοριακής δυναμικής
Μια νέα μελέτη εξετάζει την αποτελεσματικότητα της γλυκόριζας στη θεραπεία του Covid-19
Μια πρόσφατα δημοσιευμένη μελέτη στο περιοδικό Frontiers in Pharmacology εξετάζει την αποτελεσματικότητα της γλυκόριζας στη θεραπεία της νόσου του κορώνα 2019 (COVID-19). Οι ερευνητές έχουν εντοπίσει διάφορους μηχανισμούς μέσω των οποίων το υγρό μειώνει τη φλεγμονώδη αντίδραση, αναστέλλει τη βλάβη των ιστών και τον κυτταρικό θάνατο, ρυθμίζει την κυτταρική επιβίωση και προάγει την ανάπτυξη του ιστού μετά από μόλυνση με το σοβαρό οξύ αναπνευστικό σύνδρομο Coronavirus 2 (SARS-COV-2).
φόντο
Λόγω της έλλειψης αποτελεσματικών θεραπευτικών παραγόντων COVID-19 με μερικές παρενέργειες, πολλά φυτικά φάρμακα έχουν αποδειχθεί αποτελεσματικά όταν περιορίζουν τη διείσδυση και την αύξηση του SARS-COV σε κύτταρα ξενιστή. Διάφορες μελέτες έχουν δείξει ότι πολλές ενεργές συνδέσεις στη γλυκόριζα, για παράδειγμα, μπορούν να εξουδετερώσουν αποτελεσματικά το SARS-COV-2 και να ελαχιστοποιήσουν τα συμπτώματα του COVID-19. Αυτές οι επιδράσεις είναι πιθανό να βασίζονται στην ικανότητα αυτών των συστατικών να αλληλεπιδρούν η αλληλεπίδραση μεταξύ του τομέα του τμήματος υποδοχέα (RBD) του SARS-COV-2 και του υποδοχέα μετατροπής της αγγειοτενσίνης-Ezym 2 (ACE2) του κυττάρου ξενιστή. Επιπλέον, η quercetin, μια ενεργή σύνδεση στη γλυκόριζα, προφανώς ο καθρέφτης της κυτοκίνης ιντερλευκίνης-6 (IL-6), ενώ η τριτοειδή Lacritz-saponin Α3 (Α3) και το γλυκυρρρρραμικό οξύ (GA) αναστέλλουν το RBD του SARS-COV-2 και της μη-διαρροτικής πρωτεΐνης 7 (NSP7).
Η μελέτη
Οι ερευνητές χρησιμοποίησαν βιοπληροφορικές αναλύσεις, μεθόδους μοριακής κουνιστή και προσομοιώσεις μοριακής δυναμικής για να προσδιορίσουν την συναισθηματική αποτελεσματικότητα των διαφόρων συστατικών με το υγρό σε σύγκριση με διάφορες δομές στόχου του ιού. Επιπλέον, η προσομοίωση μοριακής δυναμικής επέτρεψε την αξιολόγηση της σταθερότητας αυτών των δεσμευμένων συμπλοκών για περαιτέρω αναλύσεις. Οι επιστήμονες χρησιμοποίησαν επίσης διάφορες βιοπληροφορικές πλατφόρμες για να εξετάσουν τους δυνητικούς μηχανισμούς δραστηριότητας της γλυκόριζας έναντι του SARS-COV-2.
Αποτελέσματα μελέτης
Από τη βάση δεδομένων της παραδοσιακής βάσης δεδομένων φαρμακολογίας του συστήματος κινεζικής ιατρικής (TCMSP), κλήθηκαν 200 συνδέσεις από το Liquorice, 11 εκ των οποίων επιλέχθηκαν. Από το σύνολο των 255 και 4.628 γονιδίων του υγρού ή του Covid-19, προσδιορίστηκαν 101 κοινοί στόχοι. Αυτά τα 101 γονίδια αναφέρονται ως "βασικοί διατομεακοί στόχοι γονιδίων". Η επακόλουθη ανάλυση αυτών των γονιδίων έδειξε ότι σχετίζονται με τη μετάδοση κυτοκίνης και τις φλεγμονώδεις αντιδράσεις. Ένα άλλο αποτέλεσμα ήταν ότι η γλυκόριζα ρυθμίζει την γονιδιακή έκφραση, την φλεγμονώδη αντίδραση των κυτοκινών και τις διάφορες διαδρομές σήματος.
Με βάση την ανάλυση μοριακής σύνδεσης, εντοπίστηκαν πολυάριθμες αλληλεπιδράσεις μεταξύ των ενεργών συστατικών και των ιικών δομών. Ορισμένες από αυτές είναι CXCL8/Phasel, IL2RA/Glycyrol, STAT3/Glycyrol και MMP1/Glyaspern F. Αυτές οι αλληλεπιδράσεις μπορούν να αναστείλουν τις φλεγμονώδεις διεργασίες, να ενεργοποιήσουν το ανοσοποιητικό σύστημα και να προάγουν την ανάπτυξη των ιστών.
Συμπεράσματα
Η παρούσα μελέτη παρέχει προβλέψεις στο Silico πώς τα διάφορα δραστικά συστατικά μπορούν να αλληλεπιδρούν σε γλυκόριζα με διάφορους προορισμούς του SARS-COV-2. Αυτά τα ευρήματα προσφέρουν νέες γνώσεις στους μηχανισμούς, μέσω των οποίων ορισμένα δραστικά συστατικά της γλυκόριζας μπορούν να αναπτύξουν το αντιικό τους αποτέλεσμα. Ωστόσο, πρέπει να σημειωθεί ότι απαιτούνται περαιτέρω εξετάσεις και κλινικές μελέτες για την επιβεβαίωση της πραγματικής αποτελεσματικότητας του υγρού-19 υγρού-19.
Αναφορά:
Cao, J., Gong, Υ., Wu, Μ., Et αϊ. (2022). Εξερεύνηση του μηχανισμού δράσης της γλυκόριζα στη θεραπεία της COVID-13 μέσω της ανάλυσης βιοπληροφορικής και της προσομοίωσης μοριακής δυναμικής. Σύνορα στη φαρμακολογία. Doi: 10.3389/fphar.2022.1003310