Forbedring av behandling av leukemi hos barn gjennom en samling av kreftgenomer

an 1 . Arbeidet lover å forbedre behandlingen - for eksempel å bevare noen barn fra det tøffeste cellegiftregimet og å gi andre de siste immunoterapiene.

dette Akutt lymfblastisk leukemi (T-all) Hope, som er omtrent 5% av all barnekreft. Arbeidet som ble publisert i dag i Nature , kan bidra til å forutsi hvem som er mindre sannsynlig å svare på behandlingen og støtte leger i valg av mer effektive terapier fra starten av.

"Det er en flott studie som vil behandle alle pasienter en veldig omfattende ressurs," sier Jan Cools, en forsker for leukemenetikk ved Flemish Institute for Biotechnology in Gent, Belgia, som ikke var involvert i forskning.

en degenerert stamcelle

T-all oppstår når en mutert stamcelle produserer store mengder unormale T-celler i benmargen, en type immunceller. Selv om overlevelsesraten for T-ALL har forbedret seg med fremgang i cellegift, ifølge studiemitoren David Teachey, en pediatrisk onkolog og forsker ved Philadelphia Children's Hospital i Pennsylvania, svarer 15-20% av barn og tenåringer tilbakefall eller har sykdommer som ikke svarer på standardbehandling. Det er derfor viktig å finne bedre biologiske markører som kan forutsi hvilke personer med T-ALL trenger målrettede terapier eller nye behandlingsmetoder.

På forhånd hadde forskning identifisert forskjellige undertyper av T-ALL, men ingen studier var stor nok til å pålitelig forutsi forløpet av sykdommen til en person utelukkende på grunn av genetiske endringer. Derfor analyserte hele DNA-sekvensen hele DNA-sekvensen fra både tumorceller og sunne celler hos mer enn 1.300 personer med T-ALL som fikk den samme behandlingen. Forskerne undersøkte også cellulært RNA for å forstå hvordan genetisk aktivitet ble endret i kreftprøvene.

Kobling av genom og resultat

Analysen avdekket 15 forskjellige t-alle undertyper, noen ikke karakterisert før. Hver undertype viste unike genetiske endringer og genuttrykksmønstre. Personer med visse undertyper hadde større sannsynlighet for å ha kreftceller i kroppen etter behandlingen, noe som kan føre til et tilbakefall av sykdommen. Personer med andre undertyper var mer sannsynlig å overleve for å forbli kreftfrie, og en undertype hadde mer sannsynlig ført til en annen type kreft andre steder i kroppen, fant forskerne.

Analysen viste også at nesten 60% av de genetiske endringene assosiert med T-ALL i DNA-seksjoner forekommer som ikke produserer proteiner, men kan påvirke genaktivitet . Disse endringene førte ofte til upassende aktivering av gener og bidro til utvikling av kreft.

Ved bruk av genetiske og kliniske data klassifiserte forskerne T-ALL etter risikonivå: veldig høyt, høyt, lavt og veldig lavt. Denne klassifiseringen kan hjelpe leger til å tilpasse behandlinger ved å anbefale sterkere cellegift eller nye immunoterapier for opera med høy risiko og mindre aggressive behandlinger for personer med mindre risiko, sier kjølig.

Studien trakk deltakere fra USA, Canada, Australia, Sveits og New Zealand. Siden den genetiske historien til en person kan påvirke deres reaksjon på behandlingen, må resultatene i forskjellige populasjoner valideres, sier studiemitutor Charles Mullighan, hematolog ved St. Jude Children's Research Hospital i Memphis.

Forskning understreker også behovet for å analysere hele DNA-sekvensen av tumorceller hos personer med T-ALL. Selv om denne 'fulle genomsekvensen' ennå ikke er utbredt på grunn av kostnadene, forventer Mullighan at den vil bli mer vanlig i fremtiden. "Studier som dette antyder den overbevisende saken om at vi i økende grad bør utføre en full genomsekvens for denne typen leukemi."