Originea virușilor: Alphafold și Inteligența Artificială oferă răspunsuri

Inteligența artificială (AI) ajută la retragerea arborelui genealogic al virușilor. Structuri proteice prezise, ​​cu

O mare parte din înțelegerea oamenilor de știință a Virale Evolution Cu toate acestea, evoluția rapidă a virușilor, în special a celor cu genemeri ARN și tendința lor de a adopta material genetic din alte organisme care secvențele genetice pot ascunde relații mai profunde și îndepărtate între viruși care vor varia în funcție de examinarea examinată.

În schimb, formele sau structurile proteinelor codificate de genele virale tind să se schimbe, ceea ce permite recunoașterea acestor conexiuni evolutive ascunse. Cu toate acestea, nu a fost posibilă compararea structurilor proteice într -o întreagă familie de virus până când instrumente precum Alphafold, care pot prezice structuri proteice la scară largă, spune Joe Grove, un virolog molecular la Universitatea din Glasgow, Marea Britanie.

Într-un articol publicat săptămâna aceasta în nature 1

cum să pătrundă virușii

Înțelegerea cercetătorilor despre evoluția flavivirusurilor se bazează în principal pe secvențe de enzime în evoluție lentă care copiază materialul lor genetic. Cu toate acestea, este remarcabil de puțin cunoscut despre originile proteinelor „intrării virale” care folosesc flavivirus pentru a pătrunde în celule și care determină gazda pe care o puteți infecta. Grove susține că acest decalaj de cunoștințe este dezvoltarea unui vaccin eficient împotriva

„La nivel de secvență, lucrurile sunt atât de divergente încât nu putem spune dacă sunt legate sau nu”, spune el. „Descoperirea în predicția structurilor proteice deschide întreaga întrebare și putem vedea lucrurile destul de clar”.

Cercetătorii au utilizat AlphaFold2 Model și esmfold, a Structural- pentru mai mult Structuri prezise de 458 de tipuri de flavivirus pentru a genera. ESMFOLD se bazează pe un model vocal care a fost instruit cu zeci de milioane de secvențe proteice. Spre deosebire de Alphafold, este nevoie de o singură secvență de intrare în loc să curgă pe mai multe secvențe de proteine ​​similare, ceea ce ar putea face util în special pentru examinarea virusurilor misterioase.

. „Pirateria genetică ar fi putut juca un rol mai mare în evoluția flavivirusului decât se credea anterior”, adaugă ea.