A vírusok eredete: Az alfafold és a mesterséges intelligencia válaszokat ad

Künstliche Intelligenz, wie AlphaFold, deckt überraschende Ursprünge von Viren auf und revolutioniert unser Verständnis der Virusfamilien.
A mesterséges intelligencia, mint például az Alphafold, feltárja a vírusok meglepő eredetét és forradalmasítja a víruscsaládok megértését. (Symbolbild/natur.wiki)

A vírusok eredete: Az alfafold és a mesterséges intelligencia válaszokat ad

<ábra class = "ábra"> nature.com/lw767/magazine-assets/d41586-02970 w/d41586-02970 W_27690070707070.JPG? https://media.nature.com/lw319/magazine-assets/D41586-02970-W/D41586-02970-W_27690070.JPG?AS=WEBP 319W "SISES =" (Max-Width) 319px, 100vw, 767px ">

A mesterséges intelligencia (AI) elősegíti a vírusok családfájának újraindítását. Javított fehérjeszerkezetek, testi szöveg "> alfafticles/dafticles/dfafloss/dfaflOrs/D41586-01383-Z" Data-Track-cegory = "testi textion"> testi szövegek "> testületek. Chatbot-inspired " proteinice ">" proteinice ">" proteinice link ">"> "PROFTICLICLE GLANGE". Meglepő kapcsolatok egy olyan víruscsaládban, amely megfertőzi és felmerül a fenyegetések.

A tudósok megértésének nagy része a

Ezzel szemben a vírusgének által kódolt fehérjék formái vagy szerkezete általában megváltozik, ami lehetővé teszi ezeknek a rejtett evolúciós kapcsolatoknak a felismerését. Joe Grove, a Glasgowi Egyetemen a Glasgow -i Egyetem molekuláris virológusának, nem lehetett összehasonlítani a fehérjeszerkezeteket egy egész víruscsaládban, amíg olyan eszközök, mint az Alphafold, amely nagymértékben megjósolja a fehérjeszerkezeteket.

Egy cikkben, amelyet ezen a héten tettek közzé a nature 1 A strukturált alapú megközelítések hatalmát mutatják be a Flaviviruses-A csoportot, amely magában foglalja a Hepatitis-C-t, a Dengue-vírusot és a Zika-vírusokat. Azok a fajok, amelyek az emberi egészségre kiemelkedő veszélyeket jelenthetnek.

Hogyan lehet behatolni a vírusokba

A kutatók megértése a flavivírusok fejlődéséről elsősorban a lassan fejlődő enzimek szekvenciáin alapul, amelyek másolják genetikai anyagukat. Figyelemre méltóan kevéssé ismert a "vírusbejegyzés" fehérjék eredeteiről, amelyek flavivírust használnak a sejtekben való áthatoláshoz, és meghatározzák a gazdaszervezetet, amelyet megfertőzhet. Grove azt állítja, hogy ez a tudásrés egy hatékony oltás fejlesztése hepat-gyulladás"> hepat cmnure "> heepatis thing charming of Colour =" Body Link "> HePatis Colnate Cade, sound Cade of Colour =" Body Link "> HePatis thuars". Évente több ezer ember.

"A sorrend szintjén a dolgok annyira eltérnek, hogy nem mondhatjuk, hogy rokonok -e vagy sem" - mondja. "A fehérjeszerkezetek előrejelzésében az áttörés megnyitja a teljes kérdést, és világosan láthatjuk a dolgokat."

A kutatók Deepminds "> Deepminds"> Deepminds "> Deepminds"> Deepminds "> data-track =" kattintanak. "https://www.nature.com/articles/d41586-024-01383-z" data-track = "kattintás" data-label = "https://www.nature.com/articles/d41586-024-01383-z" data-track-category = "Body Link"> Alphafold2 . "https://www.nature.com/articles/d41586-03539-1" data-track = "click" data-label = "https://www.nature.com/articles/d41586-03539-1" Data-Track-Kategória Text Link "> Esmfold, A Strukturális- Prediktív eszközök, amelyeket fejlesztettek ki a technológiam meta-meta-meta-meta-meta-meta>. A 458 flavivírus-spzies előrejelzett szerkezete. Az ESMfold egy hangmodellen alapul, amelyet tízmillió fehérjekorral edzett. Az Alphafold -tal ellentétben csak egy bemeneti szekvenciát vesz igénybe, ahelyett, hogy több hasonló fehérjék szekvenciáján versenyezne, ami különösen hasznos lehet a titokzatos vírusok vizsgálatához.

<ábra class = "ábra">

Az előrejelzett struktúrák lehetővé tették a szerzők számára, hogy azonosítsák a vírusos belépési fehérjéket, amelyek szekvenciái nagymértékben különböznek a jól ismert flavivírusoktól. Találtak néhány váratlan kapcsolatot. A hepatitis C -t tartalmazó víruscsoport egy rendszert használ a pestivírusokhoz hasonló sejtek megfertőzésére - egy olyan csoport, amely magában foglalja a klasszikus sertésinfluenza vírust, sertésekben vérzéses lázot okoz, és más állati patogén.

Az AI-alapú összehasonlítások azt mutatták, hogy ez a bemeneti rendszer különbözik a sok más flavivírustól. "Nem tudjuk, honnan származik a bemeneti rendszer a hepatitis C és rokonai számára. Meg lehetett találni" - mondja Grove.

baktériumok által ellopott

A várható struktúrák azt is kimutatták, hogy a Zika és a dengue-vírusok jól megvizsgált bejárati fehérjéje ugyanolyan eredetű, mint a hatalmas genomokkal rendelkező "furcsa és csodálatos" flavivírusok, beleértve a Haseki kullancsvírust is, amely az emberekben lázot válthat ki. Egy másik nagy meglepetés az volt, hogy felfedezés volt, hogy néhány flavivírusnak olyan enzim van, amelyet a baktériumok látszólag elloptak.

"Ez példátlan lenne"-mondja Mary Petrone virológus, az ausztráliai Sydney-i Egyetemen, nem az lenne, ha a csapatának felfedezné egy hasonló lopást egy különösen "furcsa és csodálatos" Flavivirus Art

David Moi, a svájci Lausanne Egyetem számítógépes biológusa azt mondja, hogy a Flavivirus tanulmány csak a jéghegy teteje, és hogy más vírusok evolúciós történeteit, sőt néhány celluláris szervezetet valószínűleg az AI-vel mondják el. "Most, hogy megnézhetjük, ezeknek a dolgoknak kis frissítést kell kapniuk" - mondja.