nature.com/lw767/magazine-assets/d41586-02970 w/d41586-02970 w_2769007070707070.jpg? https://media.nature.com/lw319/magazine-assets/d41586-02970-w/d41586-02970-w_27690070.jpg?as=webp 319W "SISES =" (Max-Vidth)

Umělá inteligence (AI) pomáhá re -dedlaw rodokmen virů. Předpokládané proteinové struktury, s alphafold” a alphafold = aliphafold a aliphafold = aliphafold = aliphafold = "https://www.nature.com aarticles/d41586-01383-z" Chatbot-inspired

Velká část porozumění vědcům is vir evolus . Avšak bleskový vývoj virů, zejména od těch s RNA genemenem, a jejich tendence přijímat genetický materiál z jiných organismů, které genetické sekvence mohou skrývat hlubší a vzdálené vztahy mezi viry, které se mají lišit v závislosti na zkoumaném.

Naproti tomu tvary nebo struktury proteinů kódovaných virovými geny mají tendenci se měnit, což umožňuje rozpoznat tato skrytá evoluční spojení. Nebylo však možné porovnat proteinové struktury napříč celou virovou rodinou, dokud nástroje, jako je Alphafold, které mohou předvídat proteinové struktury ve velkém měřítku, říká Joe Grove, molekulární virolog na University of Glasgow ve Velké Británii.

V článku publikovaném tento týden v Nature 1 Ukažte sílu a strukturovaného přístupu založené na založeném přístupe Patogenní a druhy, které by mohly představovat vznikající hrozby pro lidské zdraví.

Jak proniknout viry

Pochopení vědců o vývoji flavivirů je založeno hlavně na sekvencích pomalu se vyvíjejících enzymů, které kopírují jejich genetický materiál. Je však pozoruhodně málo známo o původech proteinů „virového vstupu“, které používají flavivirus k pronikání do buněk a které určují hostitele, kterého můžete infikovat. Grove tvrdí, že tato mezera v znalostech je vývoj efektivní vakcíny proti

„Na úrovni sekvence jsou věci tak odlišné, že nemůžeme říci, zda jsou spojeny nebo ne,“ říká. "Průlom v predikci proteinových struktur otevírá celou otázku a my můžeme věci vidět zcela jasně."

Vědci použili esmfold, a Structural- virus hepatitidy C e1 glykoprotein předpovídaný pomocí Colabfold-alpahfold2. W_27690182.jpg

Předpokládané struktury umožnily autorům identifikovat virové proteiny podtržení, jejichž sekvence se velmi liší od sekviálů známého flaviviru. Našli některá neočekávaná spojení. Skupina virů, která zahrnuje hepatitidu C, používá systém k infikování buněk, které jsou podobné škůdcem - skupinu, která zahrnuje klasický virus prasečí chřipky, způsobuje hemoragickou horečku u prasat a další patogenní zvíře.

Srovnání založené na AI ukázalo, že tento vstupní systém se liší od mnoha dalších flavivirů. "Nevíme, odkud váš vstupní systém pochází pro hepatitidu C a jeho příbuzných. Mohlo to být vynalezeno," říká Grove.

ukradeno bakteriemi

Předpokládané struktury také ukázaly, že dobře prozkoumané vstupní proteiny virů Zika a dengue mají stejný původ jako u „podivných a úžasných“ flavivirů s obrovskými genomy, včetně viru Hasseki Tick, které mohou u lidí vyvolat horečku. Dalším velkým překvapením byl objev, že některé flaviviry mají enzym, který byl zjevně ukraden bakteriemi.

„To by bylo bezprecedentní,“ říká virologka Mary Petroneová z University of Sydney v Austrálii, nebylo by to pro objev jejího týmu v letošním roce podobného krádeže s obzvláště „podivným a úžasným“ flavivirus art

. „Genetická pirátství mohla hrát větší roli při vývoji flaviviru, než se dříve myslelo,“ dodává.

David Moi, počítačově podporovaný biolog na University of Lausanne ve Švýcarsku, říká, že studie flaviviru je pouze vrcholem ledovce a že evoluční příběhy jiných virů a dokonce i některých buněčných organismů jsou pravděpodobně s AI vyprávěny. "Teď, když se můžeme podívat, všechny tyto věci musí získat malou aktualizaci," říká.