Учените работят върху гените на чревните бактерии при живи мишки

Учените работят върху гените на чревните бактерии при живи мишки
Учените са проектирали инструмент за обработка на геноми, който бактериалната популация в Darmmikrobiom Живите мишки могат да променят 1 .
.Инструментът-вид "базов редактор"-промени целевия ген в повече от 90% от Escherichia coli Colony в рамото на мишката, без промененият ген да образува потенциално вредни копия на себе си. „Мечтаехме да можем“, казва Ксавиер, синтетичен биолог, Eligo Bioscience, компания за биотехнологии в Париж. Резултатите бяха публикувани в природа днес.
Няколко изследователски екипа се опитаха да направят генетични промени в чревните бактерии на мишки, но да постигнат това в организма беше предизвикателство. 4 , up> 3 , 2 . Досега базовите редактори, които обменят нуклеотидна основа за друг пример за преобразуване на А в G-без разрушаване на двойната верига на ДНК, не са в състояние да променят достатъчно целевата бактериална популация, за да бъдат ефективни. Това е така, защото векторите, в които са били доставени само целеви рецептори, които са често срещани при бактерии, които са култивирани в лабораторията.
Иновативна система за доставка
За преодоляване на тези препятствия, конструираха Duports и неговите колеги, превозно средство за доставка, използвайки компоненти на бактериофаг -вирус, който заразява бактериите -до различни e. Coli рецептори, които се експресират в чревната среда. Този вектор носеше основен редактор, който специфичен e. Coli -gene насочен. Изследователите също усъвършенстваха системата, за да предотвратят репликирането и разпространението на редактираните гени.
Екипът въведе основния редактор в мишки и го използва на e. Промяна на coli -gen, която произвежда β млечни маси -ензими, които насърчават бактериалната резистентност към различни видове антибиотици. Около 93% от целевите бактерии са редактирани около осем часа след лечението.
Тогава изследователите адаптираха базовия редактор, така че той e. Coli -генген може да модифицира, който произвежда протеин, който трябва да играе роля при няколко невродегенеративни и автоимунни заболявания. Делът на редактираните бактерии е около 70%три седмици след лечението. В лабораторията учените също успяха да използват инструментите за напрежение на стъблата от e. Coli и Klebsiella pneumoniae , които могат да причинят пневмония. Това показва, че системата за редактиране може да бъде адаптирана към различни бактериални щамове и видове.
Тази базова система за седация представлява „критичен прогрес“ в разработването на инструменти, които могат да променят бактериите директно в червата, казва Чейс Бейсел, химически инженер в Института Хелмхолц за изследване на инфекцията, базиран на РНК във Вюрзбург, Германия. Проучването „отваря възможността да работи върху микробите за борба с болестите, като същевременно предотвратява манипулираната ДНК“, добавя той.
Следващата стъпка на Duports и неговите колеги е разработването на миши модели с болести, причинени от микробиома, за да се измери дали специфичните редакции на ген имат положително влияние върху тяхното здраве.
-
Brödel, A. K. et al. Nature
-
Gencay, Y. M. et al. Природна биотехнол. 42 , 265–274 (2024).
-
lam, K. N. et al. клетъчен представител 37 , 109930 (2021).
-
selle, K. et al. MBIO 11 , E00019-20 (2020).