A agresívna rakovina krvi, ktorá postihuje predovšetkým deti, má podľa genómovej analýzy 15 rôznych podtypov, z ktorých každý je spojený so špecifickým výsledkom a reakciou na lieky. 1. Práca sľubuje zlepšenie liečby – napríklad ušetrí niektoré deti od najtvrdších chemoterapeutických režimov a iným poskytne najnovšie imunoterapie.

Toto podrobná klasifikácia dláždi cestu pre cielené terapie, hovoria výskumníci, a ponúka ľuďom s T bunkami akútna lymfoblastická leukémia (T-ALL) Hope, ktorá predstavuje približne 5 % všetkých detských rakovín. Tí, ktorí sú dnesPrírodaPublikovaná práca by mohla pomôcť predpovedať, kto bude s menšou pravdepodobnosťou reagovať na liečbu, a pomôcť lekárom vybrať si od začiatku účinnejšie terapie.

„Je to skvelá štúdia, ktorá bude veľmi bohatým zdrojom pre každého, kto lieči pacientov s T-ALL,“ hovorí Jan Cools, výskumník genetiky leukémie z Flámskeho inštitútu biotechnológie v Gente v Belgicku, ktorý sa na výskume nezúčastnil.

Degenerovaná kmeňová bunka

K T-ALL dochádza, keď mutovaná kmeňová bunka v kostnej dreni produkuje veľké množstvo abnormálnych T buniek, čo je typ imunitných buniek. Hoci sa miera prežitia pre T-ALL zlepšila s pokrokom v chemoterapii, 15-20% detí a dospievajúcich má recidívy alebo má formy ochorenia, ktoré nereagujú na štandardnú liečbu, podľa spoluautora štúdie Davida Teacheyho, detského onkológa a výskumníka z Detskej nemocnice vo Philadelphii v Pensylvánii. Preto je dôležité nájsť lepšie biologické markery, ktoré dokážu predpovedať, ktorí ľudia s T-ALL potrebujú cielenú terapiu alebo nové liečebné prístupy.

Predtým výskum identifikoval rôzne podtypy T-ALL, ale žiadna štúdia nebola dostatočne veľká na to, aby spoľahlivo predpovedala progresiu ochorenia človeka len na základe genetických zmien. Teachey a jeho kolegovia teda analyzovali celú sekvenciu DNA nádorových buniek aj zdravých buniek od viac ako 1300 ľudí s T-ALL, ktorí dostali rovnakú liečbu. Výskumníci tiež skúmali bunkovú RNA, aby pochopili, ako sa génová aktivita zmenila vo vzorkách rakoviny.

Spojenie genómu a výsledku

Analýza odhalila 15 rôznych podtypov T-ALL, niektoré predtým necharakterizované. Každý podtyp vykazoval jedinečné genetické zmeny a vzory génovej expresie. Ľudia s určitými podtypmi mali väčšiu pravdepodobnosť, že po liečbe ostanú v tele rakovinové bunky, čo môže viesť k recidíve ochorenia. Ľudia s inými podtypmi mali väčšiu pravdepodobnosť, že prežijú a zostanú bez rakoviny, a jeden podtyp s väčšou pravdepodobnosťou povedie k inému typu rakoviny inde v tele, zistili vedci.

Analýza tiež ukázala, že takmer 60 % genetických zmien súvisí s T-ALL Vyskytujú sa úseky DNA, ktoré neprodukujú proteíny, ale môžu ovplyvniť aktivitu génov. Tieto zmeny často viedli k nevhodnej aktivácii génov a prispeli k rozvoju rakoviny.

Pomocou genetických a klinických údajov vedci klasifikovali T-ALL podľa úrovne rizika: veľmi vysoké, vysoké, nízke a veľmi nízke. Táto klasifikácia by mohla pomôcť lekárom prispôsobiť liečbu odporúčaním silnejšej chemoterapie alebo nových imunoterapií pre vysokorizikových ľudí a menej agresívnych liečebných postupov pre ľudí s nižším rizikom, hovorí Cools.

Štúdia prilákala účastníkov zo Spojených štátov, Kanady, Austrálie, Švajčiarska a Nového Zélandu. Pretože genetická anamnéza človeka môže ovplyvniť jeho reakciu na liečbu, výsledky je potrebné overiť v rôznych populáciách, hovorí spoluautor štúdie Charles Mullighan, hematológ z Detskej výskumnej nemocnice St. Jude v Memphise, Tennessee.

Výskum tiež zdôrazňuje potrebu analyzovať celú sekvenciu DNA nádorových buniek u ľudí s T-ALL. Hoci toto „sekvenovanie celého genómu“ ešte nie je široko používané kvôli jeho nákladom, Mullighan očakáva, že sa v budúcnosti stane bežnejším. "Štúdie, ako je táto, sú presvedčivým dôkazom, že by sme sa mali čoraz viac usilovať o sekvenovanie celého genómu pre tento typ leukémie."