Poprawa leczenia białaczki u dzieci poprzez zbiór genomów raka
Poprawa leczenia białaczki u dzieci poprzez zbiór genomów raka
„Jest to świetne badanie, które będzie leczyć pacjentów z T-wszystkich bardzo obszernych zasobów”, mówi Jan Cools, badacz białaczki w Flamandzkim Instytucie Biotechnologii w Ghent w Belgii, który nie był zaangażowany w badania.
Zdegenerowana komórka macierzysta
T-all występuje, gdy zmutowana komórka macierzysta wytwarza duże ilości nieprawidłowych komórek T w szpiku kostnym, rodzajem komórek odpornościowych. Chociaż wskaźniki przeżycia T-ALL poprawiły się wraz z postępem w chemioterapii, według badań MITutor David Teachey, onkolog pediatryczny i badacz w Philadelphia Children's Hospital w Pensylwanii, 15-20% dzieci i nastolatków doświadcza nawrotów lub ma formy choroby, które nie reagują na standardowe leczenie. Dlatego ważne jest, aby znaleźć lepsze markery biologiczne, które mogą przewidzieć, które osoby z t-all potrzebują ukierunkowanych terapii lub nowych podejść do leczenia.
Z góry badania zidentyfikowały różne podtypy T-ALL, ale żadne badanie nie było wystarczająco duże, aby niezawodnie przewidzieć przebieg choroby osoby wyłącznie z powodu zmian genetycznych. Dlatego cała sekwencja DNA przeanalizowała całą sekwencję DNA zarówno z komórek nowotworowych, jak i zdrowych komórek ponad 1300 osób z T-ALL, które otrzymały to samo leczenie. Naukowcy zbadali również komórkowy RNA, aby zrozumieć, w jaki sposób zmieniono aktywność genetyczną w próbkach raka.Łączenie genomu i wyniku
Analiza ujawniła 15 różnych podtypów T-ALL, niektóre nie charakteryzowane wcześniej. Każdy podtyp wykazywał unikalne zmiany genetyczne i wzorce ekspresji genów. Osoby z określonymi typami podrzędnymi miały większe szanse na komórki rakowe w organizmie po leczeniu, co może prowadzić do nawrotu choroby. Naukowcy stwierdzili, że osoby z innymi typami podrzędnymi przeżyją, a podtyp, a podtyp bardziej prawdopodobny doprowadził do innego rodzaju raka w innych częściach organizmu, odkryli naukowcy.
Analiza wykazała również, że prawie 60% zmian genetycznych związanych z T-ALL w Występują sekcje DNA, które nie wytwarzają białek, ale mogą wpływać na aktywność genów . Zmiany te często prowadziły do niewłaściwej aktywacji genów i przyczyniły się do rozwoju raka.
Wykorzystując dane genetyczne i kliniczne, naukowcy sklasyfikowali T-ALL po poziomie ryzyka: bardzo wysoki, wysoki, niski i bardzo niski. Ta klasyfikacja może pomóc lekarzom w dostosowaniu leczenia, zalecając silniejszą chemioterapię lub nowe immunoterapie do opery o wysokim ryzyku i mniej agresywne leczenie osób o mniejszym ryzyku, mówi Cools.
Badanie przyciągnęło uczestników ze Stanów Zjednoczonych, Kanady, Australii, Szwajcarii i Nowej Zelandii. Ponieważ historia genetyczna osoby może wpłynąć na ich reakcję na leczenie, wyniki w różnych populacjach muszą zostać zatwierdzone, mówi mitutor badań Charles Mullighan, hematolog ze szpitala badawczego dla dzieci St. Jude w Memphis.
Badania podkreślają również potrzebę analizy całej sekwencji DNA komórek nowotworowych u osób z T-ALL. Chociaż ta „pełna sekwencja genomu” nie jest jeszcze powszechna ze względu na swoje koszty, Mullighan oczekuje, że stanie się bardziej powszechna w przyszłości. „Takie badania sugerują przekonujący przypadek, że powinniśmy coraz częściej przeprowadzać pełną sekwencję genomu dla tego rodzaju białaczki”.
-
pölönen, P. i in. Nature