A agresivní rakovina krve, který primárně postihuje děti, má podle genomické analýzy 15 různých podtypů, z nichž každý je spojen se specifickým výsledkem a reakcí na léky. 1. Práce slibuje zlepšení léčby – například ušetří některé děti od nejtvrdších chemoterapeutických režimů a jiným poskytne nejnovější imunoterapii.

Tento podrobná klasifikace dláždí cestu pro cílené terapie, říkají vědci, a nabízí lidem s T buňkami akutní lymfoblastická leukémie (T-ALL) Hope, která představuje přibližně 5 % všech dětských rakovin. Ty v dnešní doběPřírodaPublikovaná práce by mohla pomoci předpovědět, kdo bude méně pravděpodobně reagovat na léčbu, a pomoci lékařům zvolit účinnější terapie od začátku.

„Je to skvělá studie, která bude velmi bohatým zdrojem pro každého, kdo léčí pacienty s T-ALL,“ říká Jan Cools, výzkumník genetiky leukémie z Vlámského institutu biotechnologií v Gentu v Belgii, který se na výzkumu nepodílel.

Degenerovaná kmenová buňka

K T-ALL dochází, když mutovaná kmenová buňka v kostní dřeni produkuje velké množství abnormálních T buněk, což je typ imunitních buněk. Ačkoli se míra přežití u T-ALL zlepšila s pokroky v chemoterapii, 15–20 % dětí a dospívajících má recidivu nebo má formy onemocnění, které nereagují na standardní léčbu, podle spoluautora studie Davida Teacheyho, dětského onkologa a výzkumníka z Children's Hospital of Philadelphia v Pensylvánii. Proto je důležité najít lepší biologické markery, které dokážou předpovědět, kteří lidé s T-ALL potřebují cílenou terapii nebo nové léčebné přístupy.

Dříve výzkum identifikoval různé podtypy T-ALL, ale žádná studie nebyla dostatečně rozsáhlá, aby spolehlivě předpověděla progresi onemocnění člověka pouze na základě genetických změn. Teachey a jeho kolegové tedy analyzovali celou sekvenci DNA jak nádorových buněk, tak zdravých buněk od více než 1300 lidí s T-ALL, kteří dostali stejnou léčbu. Vědci také zkoumali buněčnou RNA, aby pochopili, jak byla změněna aktivita genů ve vzorcích rakoviny.

Propojení genomu a výsledku

Analýza odhalila 15 různých podtypů T-ALL, některé dříve necharakterizované. Každý podtyp vykazoval jedinečné genetické změny a vzorce genové exprese. Lidé s určitými podtypy měli větší pravděpodobnost, že po léčbě zůstanou v těle rakovinné buňky, což může vést k relapsu onemocnění. Lidé s jinými podtypy měli větší pravděpodobnost, že přežijí a zůstanou bez rakoviny, a jeden podtyp s větší pravděpodobností povede k jinému typu rakoviny jinde v těle, zjistili vědci.

Analýza také ukázala, že téměř 60 % genetických změn souvisí s T-ALL Objevují se úseky DNA, které neprodukují proteiny, ale mohou ovlivňovat genovou aktivitu. Tyto změny často vedly k nevhodné aktivaci genů a přispěly k rozvoji rakoviny.

Pomocí genetických a klinických dat vědci klasifikovali T-ALL podle úrovně rizika: velmi vysoké, vysoké, nízké a velmi nízké. Tato klasifikace by mohla lékařům pomoci přizpůsobit léčbu tím, že doporučí silnější chemoterapii nebo nové imunoterapie pro vysoce rizikové lidi a méně agresivní léčbu pro osoby s nižším rizikem, říká Cools.

Studie přilákala účastníky ze Spojených států, Kanady, Austrálie, Švýcarska a Nového Zélandu. Vzhledem k tomu, že genetická historie člověka může ovlivnit jeho reakci na léčbu, je třeba výsledky ověřit v různých populacích, říká spoluautor studie Charles Mullighan, hematolog z Dětské výzkumné nemocnice St. Jude v Memphisu, Tennessee.

Výzkum také zdůrazňuje potřebu analyzovat celou sekvenci DNA nádorových buněk u lidí s T-ALL. Ačkoli toto „sekvenování celého genomu“ není kvůli své ceně zatím široce používáno, Mullighan očekává, že se v budoucnu stane běžnějším. "Studie, jako je tato, ukazují přesvědčivý případ, že bychom měli stále více usilovat o sekvenování celého genomu pro tento typ leukémie."