严重的错误瘟疫DNA工具是生物学中的工作动物
严重的错误瘟疫DNA工具是生物学中的工作动物
实验室 - 现代生物学的工作马匹制作的plasmide有问题。研究人员通过分析了在实验室中生产的2500多个血浆，并发送给提供诸如病毒中的结构之类的服务，以便可以将它们用作基因疗法，从而对圆形DNA结构进行了系统评估。该小组发现，几乎一半的纤溶化设计误差都存在，其中包括对治疗基因表达至关重要的序列中的误差。研究人员上个月在预印式服务器Biorxiv
这项研究揭示了俄勒冈州健康与科学大学的遗传学家Hiroyuki Nakai说，对实验室实施质粒的实施“缺乏知识”，他不参与工作。他已经注意到实验室中造成的质粒问题，但对研究列出的错误频率感到惊讶。他补充说，由于质粒设计的错误，可能有许多科学作品已经发表了许多科学作品。
浪费时间
plasmide是生物学实验室中流行的工具，因为细菌（包括广泛的模型有机体） escherichia coli ，使用结构来存储和替换基因。这意味着生物学家可以生产含有各种有趣基因的设计师plasmide，然后 e。大肠杆菌可以说服它们记录下来并制作许多副本。
现在在VectorBuilder Lahn说，他不断面对这个问题 - 因此他决定系统地对其进行评估。他说，当客户提交有缺陷的plasmide时，“他们浪费了很多时间”，而质量控制的其他步骤则增加了纤溶实生产及其在病毒中的包装的成本。
对矢量构造团队的分析导致超过2500个额定质粒的错误。一些包含编码蛋白质的基因，用于 e。大肠杆菌是有毒的，这意味着它们可以放慢或停止生物学家的生物，以复制其等离子物。其他旨在用于对这些病毒有毒的病毒编码蛋白质包装的包装。有些包含可以在质粒突变中积累的重复DNA序列。
错误
发现Lahn及其同事的最常见错误与基因治疗的关键工具有关。疗法通常被包装在与腺相关的病毒（AAV）中，这些病毒基本上是无害的，可以将治疗传递到细胞中。在为这些AAVS夹心研究人员生成纤溶酶时，在被称为ITR的序列之间的治疗基因并在确保该基因包装在病毒中以进行输送时起着至关重要的作用。这些序列基本上发送了细胞的生物信号，该信号说“我属于该病毒”。但是，该小组发现，研究中约有40％的AAV血浆在ITR地区发生了突变，可以伪造这一重要信息。如果研究人员使用了错误设计的plasmide，他们的基因疗法就无法正常工作，科学家可能需要很长时间才能找出原因。
马克·凯（Mark Kay）是加利福尼亚州斯坦福大学医学院的儿科和遗传学专家，也首先看到质粒断层会延迟实验室项目。但是，他有信心科学家可以识别并解决这些错误。他说，基因治疗研究人员知道可能存在ITR问题，并且在临床环境中的错误不太可能。这是因为美国食品药品监督管理局等监管机构具有严格的标准，研究人员有义务在诊所使用之前仔细分析其等离子物。
nakai说，通过测序对错误的质粒综述可以吸引研究人员意识到研究中强调的问题。 Nakai说，一些公司，包括俄勒冈州尤金的质粒，消除加利福尼亚州海沃德的生物药物，每样本的质粒测序均约为15.00美元。他还建议新的实验室工人花时间向经验丰富的质粒设计师学习；他说，这是一个乏味的手动过程，但是如果您犯了一个错误，他可能会浪费大量的时间和金钱。
马萨诸塞州沃特敦的非营利组织Addgenene首席科学官Melina Fan表示，实验室避免问题的另一种方法是使您的质粒序列公开访问。 FAN说，Addgene提供了这样的存储库，并“对存储的plasmide进行了序列，并通过网站传达序列数据以供社区使用”。检查质粒很重要。
lahn希望对他的团队的分析将研究人员的注意力指向这些工作动物实验室工具通常是理所当然的事实。他说：“工具的健康是人们不考虑的事情。”