Dovzetnost za anonimne baze podatkov za kršitve varstva podatkov

V preteklosti se je mislilo, da nabori podatkov z eno celico niso tako dovzetni za kršitve varstva podatkov, zaradi stopnje "hrupa" ali variacije genske ekspresije med različnimi celicami. Toda Gürsoy in njena ekipa sta lahko dokazala, da temu ni tako.

Skupina je pregledala tri javno dostopne nabore podatkov z eno celico, ki so vsebovali krvne celice ljudi z lupusom, kronično avtomobilsko bolezen. Raziskovalci so ugotovili, da lahko podatke za gensko izražanje uporabijo za napovedovanje strukture genoma osebe s kombiniranjem teh vrednosti z informacijami o kvantitativnih lokusih lastnosti (EQTL). Podrobnosti o variacijah EQTLS v kromosomu, ki so v korelaciji z gensko ekspresijo-so tudi javno dostopne v naborih podatkov z eno celico.

Da bi preizkusili zanesljivost svojega dela, so raziskovalci preverili svoje napovedi genoma na podlagi baze podatkov o genomu, ki ustreza uporabljenim celicam. Z ustreznim genomom so lahko povezali večino zapisov podatkov, s stopnjo natančnosti nad 80 %.

Poškodbe varstva podatkov bi lahko imele resnične posledice, kot je diskriminacija na delovnem mestu, pravi Gürsoy. Dodaja, da bi lahko puščanje celo vplivalo na prihodnje generacije, saj se lahko genetske značilnosti prenesejo na potomce. "Vse, kar o nas pozna, izvajajo generacije," pravi.

Bradley Malin, ki na področju obsežne izmenjave genomov na univerzi Vanderbilt v Nashvillu v Tennesseeju, raziskave, opisuje študijo kot "novo razširitev in prispevek k literaturi". Dodaja, da bi lahko prihodnje raziskave preučile, ali bi lahko podatki genoma povezali tudi v večjih zapisih podatkov, ki vsebujejo vzorce na tisoče ali milijone ljudi.

Tekmovalni interesi

Znanstveniki niso prepričani, kako se najbolje spoprijeti s pomisleki glede varstva podatkov. "Obstaja želja po zaščiti zasebnosti posameznika, pa tudi želja po kolektivni promociji medicinskih raziskav, ki so na žalost v nasprotju drug z drugim," pravi Mark Gerstein, ki raziskuje na univerzi Yale v New Havenu, Connecticut, Medic Data. Najpreprostejša rešitev bi bila otežitev dostopa do genetskih podatkov, vendar bi to negativno vplivalo na raziskave, pravi. "Moramo deliti in zbirati velike količine informacij," pojasnjuje. "Če vse blokiramo in naredimo bolj zasebno, resnično ovira celoten postopek."

V svoji raziskavi Gürsoy in njeni sodelavci zahtevajo večjo preglednost tveganj za udeležence, ki delijo podatke o genom, in predlagajo, da bi raziskovalci zagotovili, da se donatorji strinjajo, da bodo posredovali svoje podatke. Drug možen način bi lahko bila šifriranje osebnih podatkov, če ste del javne baze podatkov. Avtorji priznavajo, da bi to zapletlo postopek ustvarjanja in čakanja na podatke, vendar meni, da bi lahko pomagal zaščititi zasebnost udeležencev.