Alttius nimettömille geenitietokannille tietosuoja rikkomusten varalta

Aikaisemmin ajateltiin, että yksisoluinen tietojoukot eivät olleet niin alttiita tietosuoja -rikkomuksille "melun" tai geeniekspression variaation vuoksi eri solujen välillä. Mutta Gürsoy ja hänen tiiminsä pystyivät todistamaan, että näin ei ole.

Ryhmä tutki kolmea julkisesti saatavilla olevaa yksisoluista tietojoukkoa, jotka sisälsivät verisoluja ihmisiltä, ​​joilla oli lupus, krooninen autotauti. Tutkijat havaitsivat, että he pystyivät käyttämään geeniekspression tietoja ihmisen genomin rakenteen ennustamiseksi yhdistämällä nämä arvot tietoihin ekspression kvantitatiivisista piirteiden lokuksista (EQTL). Kromosomin EQTLS-variaatioiden yksityiskohdat, jotka korreloivat geeniekspression kanssa-ovat julkisesti saatavilla myös yksisoluisissa tietojoukkoissa.

heidän työnsä luotettavuuden testaamiseksi tutkijat tarkistivat genomin ennusteensa genomitietokannan perusteella, joka vastasi käytettyjä soluja. He pystyivät yhdistämään useimmat tietotietueet vastaavaan genomiin, ja tarkkuusaste oli yli 80 %.

Tällaisilla tietosuojavammilla voi olla todellisia seurauksia, kuten syrjintä työpaikalla, Gürsoy sanoo. Se lisää, että vuotoilla voi olla jopa vaikutus tuleviin sukupolviin, koska geneettiset piirteet voidaan siirtää jälkeläisille. "Sukupolvet jatkavat kaikkea meistä tietoa", hän sanoo.

Bradley Malin, joka Nashvillen Vanderbiltin yliopistossa, Tennessee, tutkimukset kuvaavat tutkimusta "uuden laajennuksen ja panoksen kirjallisuuteen". Hän lisää, että tulevaisuuden tutkimuksessa voidaan tutkia, voisiko genomitiedot yhdistää myös suurempiin tietorekisteriin, jotka sisältävät tuhansien tai miljoonien ihmisten näytteet.

Kilpailun edut

Tutkijat ovat epävarmoja siitä, kuinka parhaiten puuttuu tietosuojaon. "Yksilön yksityisyyttä on halu suojata, mutta myös halu edistää lääketieteellistä tutkimusta yhdessä, ja nämä ovat valitettavasti ristiriidassa toistensa kanssa", sanoo Mark Gerstein, joka tutkii Yalen yliopistossa New Havenissa, Connecticutissa, Medic Data. Yksinkertaisin ratkaisu olisi tehdä pääsy geneettiseen tietoon vaikeampaa, mutta se vaikuttaisi negatiivisesti tutkimukseen, hän sanoo. "Meidän on jaettava ja yhdistettävä suuria määriä tietoa", hän selittää. "Jos estämme kaiken ja teemme siitä yksityisemmän, se todella estää koko prosessia."

heidän tutkimuksessaan Gürsoy ja hänen kollegansa vaativat suurempaa avoimuutta riskistä osallistujille, jotka jakavat genomitietonsa, ja ehdottavat, että tutkijoiden on varmistettava, että avunantajat suostuvat välittämään tietonsa. Toinen mahdollinen tapa voisi olla henkilötietojen salaus, jos olet osa julkista tietokantaa. Kirjailijat tunnustavat, että tämä vaikeuttaisi tietojen luomis- ja odotustietojen luomisprosessia, mutta se voi auttaa suojaamaan osallistujien yksityisyyttä.