AI -proteinprognosverktyg AlphaFold3 nu tillgängligt som öppen källkod

Von Natur.wiki Autoren-Team

AlphaFold3 von DeepMind ist jetzt Open Source. Forscher können das AI-Tool zur Proteinstrukturvorhersage für nicht-kommerzielle Zwecke nutzen.
AlphaFold3 från DeepMind är nu öppen källkod. Forskare kan använda AI-verktyget för proteinstrukturprognos för icke-kommersiella ändamål. (Symbolbild/natur.wiki)

alphafold3 är äntligen tillgängligt. Sex månader efter Google DeepMind Papers now HED HAPPERA BAKTURDEN VIAL HAPPERA BAKTAGAVAINSPROLLEPROTERNING < Forskare kan nu och den konstgjorda användningsverktyget 11: e.

"Vi är mycket glada över att se vad folk gör med det", säger John Jumper, som leder AlphaFold-teamet på DeepMind och förra månaden tillsammans med VD Demis Hassabis En del av kemi Nobelpriset 2024 vann För sitt arbete på KI-verktyget.

i motsats till sina föregångare, alphafold3 AlphaFold2 var fallet-deepmind gav åtkomst via en webbserver som begränsade antalet och typen av förutsägelse av forskarna.

Det är kritiskt att AlphaFold3 -servern inte tillät forskare att förutsäga hur proteiner reagerar i närvaro av potentiella läkemedel. Men nu innebär DeepMinds beslut att släppa koden som akademiska forskare kan förutsäga sådana interaktioner genom att använda själva modellen.

Företaget uppgav initialt att tillhandahållandet av AlphaFold3 endast är rätt balans mellan tillgång för forskning och skydd av kommersiella ambitioner via en webbserver. Isomorphic Labs, en spin-off från DeepMind i London, använder AlphaFold3 i läkemedelsforskning.

however moved the publication of alphafold3 without its code or Model weights parameters that were erhållet genom att utbilda programvaran på proteinstrukturer och annan data - kritik av forskare som sa att detta steg undergrävde reproducerbarheten. DeepMind drog snabbt konsekvenserna och sa att en öppen källkodsversion av verktyget görs tillgänglig inom sex månader.

Alla kan nu ladda ner ALPHAFOLD3 -programvarukoden och använder den inte kommersiellt. För närvarande har emellertid endast forskare med akademisk anknytning tillgång till utbildningsvikterna på begäran.

versioner

DeepMind har konkurrens: Under de senaste månaderna har flera företag

Det faktum att flera replikationer av AlphaFold3 redan har skapats visar att modellen var reproducerbar, även utan öppen källkod, säger Pushmeet Kohli, chef för AI för vetenskap vid DeepMind. Han tillägger att han i framtiden önskar fler diskussioner om publikationsstandarderna i ett område som alltmer befolkas av akademiska och entreprenörsforskare.

ALPHAFOLD2 Open Source Nature ledde till en innovationsbökning från andra forskare. Till exempel använde vinnarna av en ny tävling om proteinmodellering AI-verktyget för att använda för att designa nya proteiner som kan binda till en cancerdestination . Jumper's Favorite Hack från AlphaFold2 kommer från ett team som använde verktyget till för att identifiera ett viktigt protein som hjälper spermier att boka på ägg .

jumper kan knappast vänta vilka överraskningar som visas efter publiceringen av AlphaJT3 - även om de inte alltid lyckas. "Människor kommer att använda det på ett konstigt sätt," förutspår han. "Ibland kommer det att misslyckas och ibland kommer det att bli framgångsrikt."