AI Prognóza prognózy AI Alphafold3 je teraz k dispozícii ako otvorený zdroj

AlphaFold3 von DeepMind ist jetzt Open Source. Forscher können das AI-Tool zur Proteinstrukturvorhersage für nicht-kommerzielle Zwecke nutzen.
Alphafold3 z DeepMind je teraz otvorený zdroj. Vedci môžu používať nástroj AI na predpoveď prognózy proteínovej štruktúry na nekomerčné účely. (Symbolbild/natur.wiki)

AI Prognóza prognózy AI Alphafold3 je teraz k dispozícii ako otvorený zdroj

Alphafold3 je konečne k dispozícii. Šesť mesiacov po Google DeepMind Vedci môžu teraz

„Sme veľmi nadšení, keď s tým ľudia robia,“ hovorí John Jumper, ktorý vedie tím Alphafold v DeepMind a minulý mesiac spolu s generálnym riaditeľom Demisom Hassabisom Časť chémie Nobelovej ceny 2024 Won Za svoju prácu na nástroji KI.

Na rozdiel od jeho predchodcov, alphafold3 Namiesto toho, aby ste uvoľnili podkladový kód-as s Alphafold2 Bol poskytnutý prípad deepmind prostredníctvom webového servera, ktorý obmedzil číslo a typ predpovedania vedcov.

Je dôležité, aby server Alphafold3 neumožnil vedcom predpovedať, ako proteíny reagujú v prítomnosti potenciálnych liekov. Teraz však DeepMindovo rozhodnutie znamená uvoľniť kód, že akademickí vedci môžu takéto interakcie predpovedať prevádzkou samotného modelu.

Spoločnosť spočiatku uviedla, že poskytovanie alfafold3 je iba správnou rovnováhou medzi prístupom pre výskum a ochranu komerčných ambícií prostredníctvom webového servera. Izomorfné laboratóriá, spin-off z DeepMind v Londýne, používa ALPHAFOLD3 vo výskume drog.

Avšak

Každý si teraz môže stiahnuť softvérový kód AlphaFold3 a komerčne ho nepoužívajte. V súčasnosti však na požiadanie majú prístup k výcvikovým váhom prístup k výcvikovým váhom iba vedci s akademickou príslušnosťou.

Verzie

DeepMind má konkurenciu: V posledných mesiacoch má niekoľko spoločností , ktoré sú známe u druhov opísaných v pôvodnom papierovom pseudokóde, podpora.

Dve čínske spoločnosti-Technologický gigant Baidu a vývojár Tikok Bytedance Have publikoval svoje vlastné modely inšpirované Alphafold3, ako aj začínajúci v San Franciscu v Kalifornii s názvom Chai Discovery.

Základnou nevýhodou týchto modelov je to, že žiadny z nich, ako napríklad Alphafold3, nemá licenciu na komerčné aplikácie, ako je drogový výskum, hovorí Mohammed Alquraishi, počítačový biológ na Columbia University v New Yorku. Model Chai Discovery, Chai-1, sa dá použiť na takúto prácu prostredníctvom webového servera, vysvetľuje Jack Dent, spoluzakladateľ spoločnosti.

Ďalšia spoločnosť, Ligo Biosciences zo San Francisca, uverejnila reštrikciu -bezplatnú verziu Alphafold3. To však ešte nemá úplné spektrum funkcií, vrátane schopnosti modelovať lieky a molekuly iného druhu proteínov.

Ostatné tímy pracujú na verziách Alphafold3, ktoré sú k dispozícii bez takýchto obmedzení: Alquraishi dúfa, že tento rok bude schopný ponúknuť úplne otvoreným zdrojovým modelom s názvom OpenFold3 tento rok. To by farmaceutickým spoločnostiam umožnilo znovu oceniť svoje vlastné verzie modelu pomocou proprietárnych údajov, ako sú štruktúry proteínov, ktoré sú viazané na rôzne lieky, ktoré by mohli potenciálne zvýšiť výkonnosť.

Počíta sa

V minulom roku došlo k zhonu nových biologických modelov AI od spoločností s rôznymi prístupmi k otvorenosti. Anthony Gitter, počítačový biológ na University of Wisconsin-Madison, nemá problém s tým, že komerčné spoločnosti vstupujú do poľa, pokiaľ dodržiavajú rovnaké pravidlá ako ostatní vedci, keď zdieľajú svoju prácu v špecializovaných časopisoch a serveroch rekvizít.

Ak DeepMind vyvolá nároky na alfafold3 vo vedeckej publikácii, „očakávam, že budete zdieľať informácie o tom, ako sa predpovede predpovedali, a modely AI a kód, aby sme ich mohli skontrolovať,“ dodáva Gitter. „Moja skupina nebude používať nástroje, ktoré nemôžeme skontrolovať.“

Skutočnosť, že už boli vytvorené niekoľko replikácií alfafold3, ukazuje, že model bol reprodukovateľný, dokonca aj bez otvoreného zdrojového kódu, hovorí Pushmeet Kohli, vedúci AI pre vedu v DeepMind. Dodáva, že v budúcnosti si želá viac diskusií o štandardoch publikácie v oblasti, ktorá je čoraz viac obývaná akademickými a podnikateľskými výskumníkmi.

Príroda Open Source Alphafold2 viedla k zvýšeniu inovácií od ostatných vedcov. Napríklad víťazi nedávnej súťaže o modelovanie proteínov použili nástroj AI na použitie na navrhovanie nových proteínov, ktoré sa môžu viazať na cieľ rakoviny . Obľúbený hack Jumper z Alphafold2 pochádza z tímu, ktorý použil tento nástroj na na identifikáciu dôležitého proteínu, ktorý pomáha spermiu rezervovať vajcia .

Jumper môže ťažko počkať, ktoré prekvapenia sa objavia po vydaní alphajt3 - aj keď nie sú vždy úspešní. „Ľudia to budú používať zvláštnym spôsobom,“ predpovedá. „Niekedy to zlyhá a niekedy to bude úspešné.“