AI -eiwitvoorspellingstool alphafold3 nu beschikbaar als een open source

Veröffentlicht:

Von:

AlphaFold3 von DeepMind ist jetzt Open Source. Forscher können das AI-Tool zur Proteinstrukturvorhersage für nicht-kommerzielle Zwecke nutzen.
Alphafold3 van DeepMind is nu open source. Onderzoekers kunnen de AI-tool gebruiken voor promitstructuurprognose voor niet-commerciële doeleinden. (Symbolbild/natur.wiki)

Alphafold3 is eindelijk beschikbaar. Zes maanden na Google DeepMind Codes-link "> COMPROSSIAL DE CODE-Code OF A en de kunstcode voor niet-gekwetste tools, As the Company in London Condition Conditionced Intoegang voor Non-Compmercial At Novel Commercial 11e.

"We zijn erg enthousiast om te zien wat mensen ermee doen", zegt John Jumper, die het Alphafold-team leidt in DeepMind en vorige maand samen met CEO Demis Hassabis Een onderdeel van de chemie Nobelprijs 2024 gewonnen Voor hun werk op de KI-tool.

In tegenstelling tot zijn voorgangers, Alphafold3 alphafold2 was de case-deepmind die toegang gaf via een webserver die het nummer en het type van de wetenschappers beperkte.

Het is van cruciaal belang dat de Alphafold3 -server niet toestond dat wetenschappers kunnen voorspellen hoe eiwitten reageren in aanwezigheid van potentiële geneesmiddelen. Maar nu betekent de beslissing van DeepMind om de code vrij te geven dat academische wetenschappers dergelijke interacties kunnen voorspellen door het model zelf te bedienen.

Het bedrijf verklaarde aanvankelijk dat het aanbieden van alphafold3 alleen de juiste balans is tussen toegang voor onderzoek en de bescherming van commerciële ambities via een webserver. Isomorfe labs, een spin-off van DeepMind in Londen, maakt gebruik van Alphafold3 in drugsonderzoek.

Verplaatsing van de publicatie van Alphafold3 zonder zijn code of modelgewicht verkregen door de software te trainen op eiwitstructuren en andere gegevens - kritiek op wetenschappers die zeiden dat deze stap de reproduceerbaarheid ondermijnde. DeepMind trok snel de gevolgen en zei dat een open source -versie van de tool binnen zes maanden beschikbaar wordt gesteld.

Iedereen kan nu de Alphafold3 -softwarecode downloaden en deze niet commercieel gebruiken. Op dit moment hebben alleen wetenschappers met academische affiliatie op verzoek toegang tot de trainingsgewichten.

versies

DeepMind heeft concurrentie: in de afgelopen maanden hebben verschillende bedrijven

Het feit dat verschillende replicaties van alphafold3 al zijn gemaakt, toont aan dat het model reproduceerbaar was, zelfs zonder open source code, zegt PushMeet Kohli, hoofd van AI voor wetenschap bij DeepMind. Hij voegt eraan toe dat hij in de toekomst meer discussies wenst over de publicatienormen in een gebied dat in toenemende mate wordt bevolkt door academische en ondernemersonderzoekers.

De Alphafold2 Open Source -aard leidde tot een innovatieboost van andere wetenschappers. De winnaars van een recente competitie voor eiwitmodellering gebruikten bijvoorbeeld het AI-tool om om nieuwe eiwitten te ontwerpen die kunnen binden aan een kankerbestemming . De favoriete hack van Jumper van Alphafold2 komt van een team dat de tool heeft gebruikt naar Om een ​​belangrijk eiwit te identificeren dat sperma helpt te boeken over eieren .

Jumper kan nauwelijks wachten, wat verrassingen verschijnen na de publicatie van alphajt3 - zelfs als ze niet altijd succesvol zijn. "Mensen zullen het op een vreemde manier gebruiken", voorspelt hij. "Soms zal het mislukken en soms zal het succesvol zijn."