AI fehérje előrejelzési eszköz alfafold3 már elérhető nyílt forráskódként
AI fehérje előrejelzési eszköz alfafold3 már elérhető nyílt forráskódként
A alfafold3 végre elérhető. Hat hónappal a Google DeepMind után Controvialis The Controvialis The Controvial The Condrovery "> Controvialis Conthrovialis Conther Acomory"> Controvialis Conthrovialis Codial The Code Ag. = "https://www.nature.com/articles/S41586-024-07487 w" data-track = "kattintás" data-label = "https://www.nature.com/articles/s41586-07487-w" data-track-category = "Body Text Link"> Papers már a Prefotein Protiction előrejelzés.
"Nagyon izgatottak vagyunk, hogy láthatjuk, mit csinálnak az emberek vele"-mondja John Jumper, aki a Deepmind Alphafold csapatát és a múlt hónapban vezeti Demis Hassabis vezérigazgatóval A KÉMIA NOBEL DÍJA 2024-es részének része a KI eszköz munkájáért. In contrast to his predecessors, Alphafold3 able to model proteins in combination with other Molekulák Ahelyett, hogy elengedné a mögöttes kódot, a az eset-mélységű hozzáférést biztosított egy webszerveren keresztül, amely korlátozta a tudósok számát és típusát.
Fontos, hogy az Alphafold3 szerver ne engedje meg a tudósoknak, hogy megjósolják, hogyan reagálnak a fehérjék potenciális gyógyszerek jelenlétében. De most DeepMind döntése azt jelenti, hogy kiadja azt a kódexet, amelyet az akadémiai tudósok maga a modell működtetésével tudnak megjósolni az ilyen interakciók. A vállalat kezdetben kijelentette, hogy az Alphafold3 rendelkezése csak a megfelelő egyensúly a kutatáshoz való hozzáférés és a webszerveren keresztüli kereskedelmi ambíciók védelme között. Az izomorf laboratóriumok, a londoni Deepmind-ból származó spin-off, az Alphafold3-at használják a kábítószer-kutatásban. Mindenki letöltheti az Alphafold3 szoftverkódot, és nem használja kereskedelmileg. Jelenleg azonban csak az akadémiai hovatartozással rendelkező tudósok kérésre hozzáférhetnek az edzési súlyokhoz. verziók A DeepMindnek van versenye: Az elmúlt néhány hónapban több vállalatnak van , amelyeket az eredeti papír pszeudokódban ismertetett fajokban ismertek.
Egy másik cég, a San Francisco -i Ligo Biosciences, az Alphafold3 korlátozásának -ingyenes verzióját tett közzé. Ennek azonban még nem rendelkezik a teljes funkciók teljes spektrumával, ideértve a különféle fehérjék gyógyszereinek és molekuláinak modellezésének képességét.
Más csapatok az Alphafold3 verzióin dolgoznak, amelyek ilyen korlátozások nélkül állnak rendelkezésre: Alquraishi reméli, hogy ebben az évben egy teljesen nyílt forráskódú modellt kínálhat. Ez lehetővé tenné a gyógyszeripari vállalatok számára, hogy a modell saját verzióinak átvételét használják védett adatok felhasználásával, például a különféle gyógyszerekhez kötött fehérjék struktúrái felhasználásával, amelyek potenciálisan növelhetik a teljesítményt.
nyitottsági számok
Tavaly az új biológiai AI modellek rohannak azoktól a cégektől, amelyek eltérő megközelítést mutatnak a nyitottsághoz. Anthony Gitternek, a Wisconsin-Madison Egyetem számítógépes biológusának nincs probléma azzal, hogy a kereskedelmi vállalatok belépnek a területére-mindaddig, amíg ugyanazokat a szabályokat követik, mint más tudósok, amikor megosztják munkájukat a speciális magazinokban és a kellékek szervereiben.
Ha a DeepMind egy tudományos kiadványban felveti az Alphafold3 -ra vonatkozó követeléseket, "várom, hogy megosztja az előrejelzések készítéséről szóló információkat, valamint az AI modelleket és a kódot, hogy ellenőrizhessük őket" - tette hozzá Gitter. "A csoportom nem fog olyan eszközöket használni, amelyeket nem tudunk ellenőrizni."
Az a tény, hogy az Alphafold3 számos replikációját már létrehozták, azt mutatja, hogy a modell reprodukálható, még nyílt forráskód nélkül is - mondja Pushmeet Kohli, a DeepMind AI tudományának vezetője. Hozzáteszi, hogy a jövőben további megbeszéléseket kíván a közzétételi előírásokról olyan területen, amelyet egyre inkább az akadémiai és vállalkozói kutatók laknak.
Az Alphafold2 nyílt forráskódú természete más tudósok innovációjához vezetett. For example, the winners of a recent competition for protein modeling used the AI tool to use új fehérjék megtervezéséhez, amelyek kötődhetnek a rákos célhoz . A Jumper kedvenc hackje az Alphafold2-től egy olyan csapatból származik, amely a Egy fontos fehérje azonosításához, amely segít a spermában a tojások lefoglalásában .
Ajumper alig tud várni, hogy mely meglepetés jelenik meg az AlphaJT3 közzététele után - még akkor is, ha nem mindig sikeresek. "Az emberek furcsa módon fogják használni" - jósolja. "Néha kudarcot vall, és néha sikeres lesz."